In DAS GEHEIMNIS DER BÄUME erzählen Luc Jacquet (Die Reise der Pinguine), Francis Hallé und Bruno Ganz (Der Untergang, Der Baader Meinhof Komplex) die Evolutionsgeschichte eines Urwalds und macht die Bäume als Lebewesen begreifbar. Mit kuriosen Allianzen und überraschenden Täuschungsmanövern sichern sie seit Jahrhunderten ihre Existenz. Ameisen werden zu Untermietern und Verteidigern riesenhafter Bäume, Insekten lassen sich von Pflanzen an der Nase herumführen und Urwaldgewächse fungieren als Regengötter. Der Film erforscht die Weisheit der Bäume und führt hinein in die Tiefen des tropischen Dschungels, in denen die Tiere über den Raum und die Bäume über die Zeit herrschen.