Doch der genaue Mechanismus dieses Magnetsinns und das Funktionieren des dazugehörigen Kompasses konnten noch nicht verstanden werden – wobei die bekannteste Hypothese von einer auf Quantenmechanik beruhenden Dynamik des Spins ausgeht. Dieser spielt demnach in Molekülen mit ungepaarten Elektronen – bekannt als Radikale – eine Rolle, die in Cryptochrom-Proteinen innerhalb der Retina der Vogelaugen zu finden sind. Man glaubt es kaum, wie rasch das scheinbar einfache Problem des Magnetsinns der Vögel zu Vermutungen über höchst komplizierte molekulare Wechselwirkungen führen kann.
