Äußerlich ähnelt er dem Mond, doch innerlich unterscheidet sich Merkur von allen anderen Körpern im inneren Sonnensystem (siehe Grafik rechts). Eigentümlich ist vor allem sein riesiger Metallkern. Die Ausmaße des inneren festen Kernanteils sind bislang noch unklar, aber der gesamte Kern (fest und flüssig) dürfte einen Radius von etwa 2030 Kilometer haben. Zusätzlich zu den Eisen- beziehungsweise Nickel-Anteilen vermuten die Forscher im flüssigen Kern eine Reihe leichterer Substanzen, beispielsweise Schwefel und Silizium. Darüber befindet sich neuen Auswertungen zufolge eine Schicht aus festem Eisensulfid. Diese vermutlich etwa 100 Kilometer mächtige Kruste ist wohl ein Alleinstellungsmerkmal Merkurs. Die Forscher vermuten, dass es sich um verfestigtes Kernmaterial handelt, das einst flüssig war. Für den gesamten Gesteinsmantel bleibt nur wenig Platz – etwa 410 Kilometer.
